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viernes, 10 de marzo de 2017

Meshable aplicación para buscar resúmenes de PubMed utilizando el MeSH y palabras clave

El tesauro MesH del NCBI sin duda es una herramientas más elegantes, eficientes y útiles para buscar información, aquí una nueva aplicación Web que permite idendificar los términos MeSH estrechamente relacionados con una consulta específica basado en la co-ocurrencia de palabras del texto y los términos MeSH indexados en los artículos, para encontrar las palabras clave que están relacionadas con cada término MeSH. De tal manera que permite hacer búsquedas en PubMed utilizando tres criterios: 1) términos MeSH, 2) Palabras clave y 3) terminos MeSH más las palabras claves.

Veamos un ejemplo: la búsqueda en PubMed para el género de plantas Camellia a la que pertenece la planta del Té Camelia sinensis, está desplegada en la siguiente liga: 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Wilbur/IRET/MESHABLE/gettopic.cgi?query=camellia

De tal forma que en el momento de esta búsqueda para Camelia sinensis se recuperan 1870 registros con el criterio 1 y 2561 para el criterio 3, esto un aumento significativo en la búsqueda lo que hace a esta herramienta una muy buena opción para hacer búsquedas más exactas en PubMed.

Los detalles están publicados en Sun Kim, Lana Yeganova, W. John Wilbur; Meshable : searching PubMed abstracts by utilizing MeSH and MeSH-derived topical terms . Bioinformatics 2016; 32 (19): 3044-3046. doi: 10.1093/bioinformatics/btw331

La aplicación está disponible en en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Wilbur/IRET/MESHABLE/